Salah satu tugas KJM UGM adalah menghantarkan program studi di lingkungan Universitas Gadjah Mada memperoleh akreditasi dan sertifikasi dengan capaian tertinggi. Oleh karena itu, berbagai kegiatan terkait akreditasi dan sertifikasi sejauh ini telah dilaksanakan KJM.
Kegiatan yang telah dilaksanakan sampai dengan akhir Oktober 2013 antara lain:
- Mendampingi prodi dalam proses penyusunan dokumen akreditasi BAN-PT (bersifat opsional) dan melakukan simulasi asesmen dokumen akreditasi BAN-PT prodi yang akan dikirimkan (wajib)
- Membuat surat pernyataan Rektor bagi prodi di lingkungan UGM dalam rangka akreditasi BAN-PT
- Menjadi koordinator sertifikasi ISO 9001:2008 untuk beberapa unit kerja di UGM
- Melaksanakan AUN Actual Quality Assessment untuk sejumlah prodi (Pendidikan Dokter, Kimia, Farmasi, Biologi, Teknik Geologi, Teknik Sipil, Ilmu Hukum, Pendidikan Dokter Gigi, Ilmu dan Industri Peternakan, dan Sastra Inggris)
- Melaksanakan AUN DIES Assessment untuk sejumlah prodi (Ilmu Komunikasi dan Manajemen Kebijakan Publik)